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Genetic screening of diploid and tetraploid cotton cultivars based on retrotransposon microsatellite amplified polymorphism markers (REMAP)

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dc.contributor.authorNoormohammadi, Zahra
dc.contributor.authorIbrahim-Khalili, Niloofar
dc.contributor.authorGhasemzadeh-Baraki, Somayeh
dc.contributor.authorSheidai, Masoud
dc.contributor.authorAlishah, Omran
dc.date.accessioned2017-02-14T09:16:40Z
dc.date.available2017-02-14T09:16:40Z
dc.date.issued2016
dc.description.abstractAbstract Continuous artificial selection and cultivation of cultivars has led to genetic erosion and loss of useful genetic loci from the available germplasm. The objective was to evaluate diploid and tetraploid cottons cultivars with REMAP. Low genetic variability within each cultivar was observed, but a high genetic variability occurred within each species (18-68%). AMOVA test revealed 63% of total genetic variability occurred due to among species genetic difference. Unique alleles were detected in the studied species, that can be used for species discrimination. REMAPs could efficiently discriminate the studied diploid from tetraploid species and may be useful for fast screening, as genetic fingerprinting of large cotton germplasm and for planning future hybridization programs.es
dc.description.abstractResumen: La selección artificial continuada y el uso de variedades ha llevado a erosión genética y pérdida de loci genéticos del germoplasma disponible. El objetivo fue evaluar variedades diploides y tetraploides de algodón por REMAP. Se observó baja variabilidad gené- tica dentro de cada variedad, pero alta dentro de cada especie (18- 68%). El AMOVA reveló que el 63% de la variabilidad genética total se produjo debido a diferencia entre especies. Se detectaron alelos únicos en las especies estudiadas, que pueden ser empleados para discriminación. REMAP podrían discriminar eficazmente las especies diploides de las tetraploides y ser últiles para el cribado rápido, actuar como huella genética del gran germoplasma de algodón y para la planificación de programas de hibridadción.es
dc.formatapplication/pdfes
dc.format.extent10es
dc.identifier.citationAnales de Biología, nº38, (2016)
dc.identifier.doihttp://dx. doi.org/10.6018/analesbio.38.15
dc.identifier.issn1989-2128
dc.identifier.issn1138-3399
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10201/52120
dc.languageenges
dc.publisherUniversidad de Murciaes
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses
dc.subjectCottones
dc.subjectGenetic diversityes
dc.subjectREMAPes
dc.subjectAlgodónes
dc.subjectDiversidad genéticaes
dc.subjectK-Means clusteringes
dc.subject.otherCDU::5 - Ciencias puras y naturales::58 - Botánicaes
dc.titleGenetic screening of diploid and tetraploid cotton cultivars based on retrotransposon microsatellite amplified polymorphism markers (REMAP)es
dc.title.alternativeCribado genético de cultivares diploides y tetraploides de algodón, basado en marcadores de polimorfismo de microsatélites en retrotransposones amplificados (REMAP)es
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees
dspace.entity.typePublicationes
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Anales de biología Vol. 38 (2016)