Browsing by Subject "PCR cuantitativa"

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    Estudio de la expresión de VSTM1 en macrófagos humanos y su posible implicación en el desarrollo de cirrosis hepática
    (2020-04-14) Rodríguez-Alcázar, Juan Francisco; Fernández-Fernández, María Dolores; García-Peñarrubia, Pilar; Martínez-Esparza Alvargonzález, María Concepción; Ruiz Alcaraz, Antonio José; Tapia Abellán, Ana; Facultades, Departamentos, Servicios y Escuelas::Departamentos de la UMU::Bioquímica y Biología Molecular B e Inmunología
    RESUMEN Uno de los objetivos de este trabajo fue el estudio bibliográfico del gen VSTM1, que codifica un receptor inhibidor recientemente descrito en fagocitos. Para ello se revisó la bibliografía publicada en revistas de investigación científica, así como las secuencias depositadas en las principales bases de datos biológicos disponibles en la red hasta el momento. Los resultados encontrados revelaron que la información depositada en las bases de datos por los diferentes autores era redundante y presentaban una nomenclatura diferente. Tras estudios de alineamiento con diferentes herramientas informáticas, pudimos establecer las equivalencias entre los datos publicados. De las 6 isoformas descritas, generadas por maduración alternativa del ARN, sólo algunas secuencias coincidieron en las bases de datos consultadas. Además, se detectó un error en la notación de la secuencia ACU00108, ya que se tradujo en glicina un codón que codifica para serina. El siguiente objetivo fue el estudio de la expresión del gen VSTM1 mediante qRT-PCR en macrófagos peritoneales obtenidos del líquido ascítico de pacientes con cirrosis hepática, y su comparación con los obtenidos para macrófagos de sangre periférica de donantes sanos, como población de referencia. Esta patología se asociada a un incremento de mediadores inflamatorios y podría estar relacionada con la desregulación de algunos de los mecanismos de control del sistema inmunitario. La qRT-PCR realizada con los cebadores diseñados para estudiar las isoformas VSTM1-v1 y v2, reveló que éstas se expresan en ambas poblaciones de macrófagos, siendo mayores los niveles de expresión del transcrito que codifica la isoforma proteíca de membrana (v1) que la secretada (v2). Además, la expresión génica de VSTM1-v1 aumenta con la diferenciación del macrófago. Sin embargo, aunque se aprecia una tendencia hacia una menor expresión en la población de macrófagos de pacientes con cirrosis, estas diferencias no fueron estadísticamente significativas.