Browsing by Subject "Chemical structure"
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- PublicationOpen AccessAccurate ring strain energies of unsaturated three-membered heterocycles with one group 13–16 element(American Chemical Society, 2022-05-02) Rey Planells, Alicia; Espinosa Ferao, Arturo; Química OrgánicaHigh-quality ring strain energy (RSE) data for 1H-unsaturated (CH)2X parent rings, where X is a group 13–16 element, are reported in addition to the 2H-isomers of the pnictogenirene rings. RSE data are obtained from appropriate homosdesmotic reactions and calculated at the DLPNO-CCSD(T)/def2-TZVPP//B3LYP-D3/def2-TZVP(ecp) level. 1H-Tallirene and 1H-plumbirene have unique donor–acceptor structures between an acetylene π(CC) orbital and an empty p orbital of a metallylene subunit (a Dewar–Chatt–Duncanson description) and therefore cannot be described as proper rings but as pseudocyclic structures. Also, 1H-indirene and 1H-oxirene lack ring critical points and constitute borderline cases of pseudorings. 1H-Unsaturated rings exhibit enhanced RSE compared to their saturated homologues. The mechanism of ring strain relaxation by increasing the s character in the lone pair (LP) of group 15–16 elements is remarkable and increases on descending the groups. Furthermore, RSE is affected by the aromatic character of group 13 rings and certain aromatic or antiaromatic character in group 14 or 15–16 rings, respectively, which tend to vanish on descending the group as shown by NICS(1) values. 2H-Unsaturated rings were found only for group 15 elements (although only 2H-azirine shows a proper cyclic structure) and displayed lower RSE (higher stability) than the corresponding 1H-isomers.
- PublicationOpen AccessBrico-moléculas: preparación de modelos moleculares a partir de la fórmula dibujada(Universidad de Murcia, Servicio de Publicaciones, 2012) Herráez, AngelLa percepción de las moléculas como entidades tridimensionales es una destreza esencial en química y biología. Muchas herramientas informáticas adecuadas dependen de la disponibilidad de archivos de coordenadas. Es, pues, interesante disponer de una herramienta que permita a cualquiera construir a voluntad un modelo para cualquier molécula. La aplicación presentada aquí, "Brico-moléculas", se ejecuta en un navegador web sin software especial y puede usarse tanto localmente (p. ej. en CD-ROM) como en internet. La interfaz integra un panel para dibujar la estructura química, un mecanismo para generar una conformación optimizada y otro panel interactivo donde se muestra ésta en tres dimensiones. Además, la optimización en tiempo real de la estructura plana hacia una conformación tridimensional añade un gran valor pedagógico, pues el usuario ve cómo los enlaces se estiran y agitan hasta que el modelo alcanza una estereoquímica correcta. El modelo generado se puede grabar o enviar al profesor para su evaluación.